O Palmeiras é um dos maiores clubes do Brasil e empilhou títulos ao longo de sua história, mas apesar disso, o Verdão teve dificuldades em se estabelecer como um dos gigantes do futebol sul-americano, tendo conquistado sua primeira Libertadores apenas em 1999 após ter sido vice-campeão em 1961 e 1968.
O Verdão garantiu sua participação no torneio conquistado ao conquistar a Copa do Brasil e a Copa Mercosul em 1998. Com um forte elenco comandado por Luiz Felipe Scolari, o alviverde contava com nomes experientes como Evair e César Sampaio, Alex, Arce e Marcos.
Ao contrário do que aconteceu em algumas edições, o regulamento da competição na época era diferente, com grupos formados por quatro times, sendo dois deles dos mesmos países.
Sendo assim, na fase de grupos o Verdão enfrentou Corinthians e os paraguaios Cerro Porteño e Olímpia. Apesar de alguns resultados adversos, a classificação para a fase seguinte veio na última rodada, com uma vitória sobre o Cerro Porteño.
Nas oitavas de final, o Palmeiras enfrentou outro brasileiro, desta vez o Vasco e garantiu a classificação com um empate 1×1 no antigo Parque Antártica e uma vitória por 4×2 em São Januário.
A próxima fase trouxe um adversário conhecido, com o Alviverde enfrentando novamente o Corinthians. No primeiro jogo, o Verdão sobrou e venceu por 2×0, mas na volta, o rival reverteu a vantagem e conseguiu levar o jogo para as penalidades. Na marca da cal o goleiro Marcos foi herói defendendo o pênalti de Vampeta para garantir a vaga nas semifinais.
O adversário das oitavas de final foi o River Plate, da Argentina, e novamente Marcos foi herói, fazendo uma partida inspirada no Monumental de Nuñez e fazendo defesas importantes, fez com que um jogo que tinha tudo para ser uma goleada, terminasse em apenas 1×0 para os Milionários. No jogo de volta, com show de Alex, que balançou as redes três vezes, o Palmeiras venceu por 3×0 e se classificou para a final.
Na decisão, o Alviverde enfrentou o Deportivo Cali, da Colômbia. Assim como na semi, o Verdão saiu derrotado por 1×0 no jogo de ida. No segundo jogo em São Paulo, em uma partida muito acirrada, conseguiu vencer por 2×1 e levar a partida para os pênaltis. Nas penalidades o Palmeiras saiu atrás depois que Zinho acertou a trave, mas Zapata e Bedoya chutaram para fora e deram o título ao Palmeiras.