Em 2016 o São Paulo perdeu seu treinador para uma seleção. Depois de Juan Carlos Osorio deixar a equipe para aceitar um convite do México em 2015, em 2016 foi a vez de Edgardo Bauza pedir demissão e assumir o comando da Argentina.
O presidente da comissão que administra a Associação Argentina de Futebol, Armando Pérez, anunciou a escolha de Bauza destacando suas características. O ex-técnico do São Paulo tinha contrato até o final de 2016 e encerrou sua passagem pelo clube com 48 partidas, somando 18 vitórias, 13 empates e 17 derrotas, alcançando um aproveitamento de 46,52%. Seu destaque foi a campanha na Taça Libertadores, chegando à semifinal, mas sendo eliminado pelo Atlético Nacional.
Apesar dos resultados dentro de campo, Bauza deixou sua marca fora das quatro linhas, promovendo uma mudança notável no comportamento da equipe. O São Paulo, antes considerado acomodado, transformou-se em um time aguerrido, destacando-se pela intensidade e determinação.
Bauza junta-se a uma lista de treinadores que deixaram o São Paulo para comandar seleções nacionais, incluindo Juan Carlos Osorio, Jorge Gomes de Lima, Vicente Feola e Aymoré Moreira.
Bauza pelo São Paulo
| Competição | J | V | E | D | GM | GC | 
|---|---|---|---|---|---|---|
| Libertadores | 14 | 5 | 4 | 5 | 21 | 15 | 
| Copa Libertadores | ||||||
| Brasil | 17 | 5 | 5 | 7 | 16 | 19 | 
| Campeonato Brasileiro | ||||||
| Brasil | 16 | 6 | 4 | 6 | 18 | 18 | 
| Campeonato Paulista | ||||||
| Total | 47 | 16 | 13 | 18 | 55 | 52 | 
FATOS
- 47 Jogos
 - 16 Vitórias (34%)
 - 13 Empates (28%)
 - 18 Derrotas (38%)
 - 55 Gols Marcados (1,17 G/J)
 - 52 Gols Sofridos (1,11 G/J)